Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ric1Q69ZJ7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms