Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pkp4Q68FH0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Pkp4Q68FH0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pkp4Q68FH0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pkp4Q68FH0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pkp4Q68FH0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pkp4Q68FH0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp4Q68FH0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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