Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnna3Q65CL1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms