Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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