Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Znf260Q62513 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf260Q62513 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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