Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Dsg1aQ61495 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1aQ61495 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms