Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms