Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HnrnpdQ60668 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HnrnpdQ60668 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms