Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp13a3Q5XF89 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp13a3Q5XF89 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms