Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms