Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccnl1Q52KE7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnl1Q52KE7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms