Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms