Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms