Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnpc3Q3UZ01 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms