Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
D130052B06RikQ3UW13 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D130052B06RikQ3UW13 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms