Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chpf2Q3UU43 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chpf2Q3UU43 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chpf2Q3UU43 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chpf2Q3UU43 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chpf2Q3UU43 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chpf2Q3UU43 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms