Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E330014E10RikQ3UL33 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms