Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf224Q3UIW8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf224Q3UIW8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms