Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx27Q3UHD6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms