Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Arfgef3Q3UGY8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Arfgef3Q3UGY8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms