Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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