Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms