Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrx1Q3TL44 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms