Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca4Q3TKT4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms