Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccbe1Q3MI99 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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