Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl9Q32KG4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms