Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Samd11Q1RNF8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms