Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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ptchd1Q14B62 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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ptchd1Q14B62 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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ptchd1Q14B62 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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ptchd1Q14B62 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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ptchd1Q14B62 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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ptchd1Q14B62 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ptchd1Q14B62 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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