Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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