Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Spatc1Q148B6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Spatc1Q148B6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Spatc1Q148B6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Spatc1Q148B6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Spatc1Q148B6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Spatc1Q148B6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Spatc1Q148B6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spatc1Q148B6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms