Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vps8Q0P5W1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms