Protein–RNA interactions for Protein: Q08879

Fbln1, Fibulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbln1Q08879 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbln1Q08879 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms