Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnma1Q08460 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnma1Q08460 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms