Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms