Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnb1Q03717 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms