Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NfiaQ02780 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfiaQ02780 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms