Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax5Q02650 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax5Q02650 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms