Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai1Q02085 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai1Q02085 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms