Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms