Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms