Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms