Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja5Q01231 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms