Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms