Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
rp9P97762 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
rp9P97762 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
rp9P97762 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms