Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nbr1P97432 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nbr1P97432 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms