Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp1P97350 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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