Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43bP86448 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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