Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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