Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx1P81068 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx1P81068 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms