Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Msx3P70354 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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